Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrm1P12657 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms