Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga5P11688 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga5P11688 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms