Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms