Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PolP11369 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolP11369 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolP11369 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolP11369 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolP11369 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PolP11369 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PolP11369 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PolP11369 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PolP11369 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolP11369 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolP11369 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolP11369 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolP11369 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolP11369 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms