Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb4P10284 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb4P10284 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms