Protein–RNA interactions for Protein: P0CG09

C2cd4d, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd4dP0CG09 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2cd4dP0CG09 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd4dP0CG09 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms