Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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