Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms