Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LtaP09225 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LtaP09225 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LtaP09225 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LtaP09225 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtaP09225 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtaP09225 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtaP09225 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtaP09225 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtaP09225 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtaP09225 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtaP09225 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtaP09225 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtaP09225 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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