Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtrP07309 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtrP07309 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtrP07309 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtrP07309 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtrP07309 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtrP07309 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtrP07309 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TtrP07309 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TtrP07309 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TtrP07309 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TtrP07309 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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