Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SparcP07214 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SparcP07214 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SparcP07214 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SparcP07214 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SparcP07214 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SparcP07214 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SparcP07214 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SparcP07214 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SparcP07214 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SparcP07214 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SparcP07214 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SparcP07214 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SparcP07214 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms