Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csf1P07141 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf1P07141 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf1P07141 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms