Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa4P06728 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms