Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa7P02830 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa7P02830 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms