Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01822 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01822 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01822 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01822 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms