Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnkO88874 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms