Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb2O88838 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms