Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ComtO88587 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ComtO88587 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ComtO88587 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ComtO88587 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ComtO88587 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ComtO88587 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ComtO88587 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ComtO88587 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms