Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf106O88466 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf106O88466 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf106O88466 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf106O88466 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms