Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vti1bO88384 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vti1bO88384 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms