Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt1O88346 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.7 ms