Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb2O55203 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb2O55203 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms