Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms