Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms