Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms