Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms