Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms