Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pkd2O35245 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms