Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ebi3O35228 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ebi3O35228 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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