Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cnih2O35089 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cnih2O35089 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih2O35089 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms