Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArxO35085 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArxO35085 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArxO35085 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ArxO35085 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ArxO35085 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ArxO35085 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArxO35085 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArxO35085 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms