Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms