Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap23O09044 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap23O09044 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap23O09044 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap23O09044 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms