Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms