Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5849J3QPE5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5849J3QPE5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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