Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c2J3QNM1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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