Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW1

Gm7137, MCG1044197, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7137J3QMW1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm7137J3QMW1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm7137J3QMW1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms