Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r34G3XA52 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms