Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc3h12bG3X9I7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc3h12bG3X9I7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms