Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933408B17RikG3X9B4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms