Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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