Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LctF8VPT3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LctF8VPT3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms