Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms