Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms