Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610001J05RikF2Z3Y9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms