Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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