Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms