Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r116E9Q6I0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn2r116E9Q6I0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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