Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17175E9Q528 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17175E9Q528 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms