Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
8030474K03RikE9Q4Y8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms